Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP1Q9UPQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms