Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX6Q9UPM6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX6Q9UPM6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHX6Q9UPM6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms