Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms