Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT2Q9UMR5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPT2Q9UMR5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms