Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN11Q9UMQ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms