Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms