Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4EQ9ULY5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms