Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms