Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH9Q9ULB4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH9Q9ULB4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH9Q9ULB4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms