Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA2Q9UL42 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms