Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDV3Q9UKY7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms