Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV3Q9UKW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV3Q9UKW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms