Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC9Q9UKV0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms