Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ADAM28Q9UKQ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ADAM28Q9UKQ2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms