Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RCAN3Q9UKA8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms