Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA1Q9UJY5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms