Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS3Q9UJD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms