Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRLS1Q9UJA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms