Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFF4Q9UHB7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFF4Q9UHB7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFF4Q9UHB7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFF4Q9UHB7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AFF4Q9UHB7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms