Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFC0

LRWD1, Leucine-rich repeat and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRWD1Q9UFC0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRWD1Q9UFC0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRWD1Q9UFC0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRWD1Q9UFC0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms