Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DBF4Q9UBU7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DBF4Q9UBU7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DBF4Q9UBU7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DBF4Q9UBU7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DBF4Q9UBU7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DBF4Q9UBU7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DBF4Q9UBU7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DBF4Q9UBU7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms