Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms