Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms