Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XCL2Q9UBD3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XCL2Q9UBD3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms