Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms