Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
REREQ9P2R6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
REREQ9P2R6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.82■■■■□ 3
REREQ9P2R6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
REREQ9P2R6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
REREQ9P2R6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
REREQ9P2R6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
REREQ9P2R6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
REREQ9P2R6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
REREQ9P2R6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
REREQ9P2R6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
REREQ9P2R6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
REREQ9P2R6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
REREQ9P2R6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.8■■■■□ 3
REREQ9P2R6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.8■■■■□ 3
REREQ9P2R6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.8■■■■□ 3
REREQ9P2R6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
REREQ9P2R6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms