Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL13Q9P2N7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms