Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNQ9P2M7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNQ9P2M7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms