Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL42Q9P2K6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms