Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDH10Q9P2E7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms