Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms