Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRN3Q9NYV6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
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