Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms