Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1Q9NXJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms