Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNAU1APQ9NX07 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms