Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD4Q9NVD3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms