Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZDHHC18Q9NUE0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms