Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A2Q9NTI2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms