Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SALL1Q9NSC2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms