Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD18Q9NS91 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms