Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ARHGAP35Q9NRY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGAP35Q9NRY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGAP35Q9NRY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms