Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SERINC1Q9NRX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERINC1Q9NRX5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms