Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRAC1Q9NRG0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms