Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFCQ9NRA1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFCQ9NRA1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms