Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPHK2Q9NRA0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms