Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CD163L1Q9NR16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CD163L1Q9NR16 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CD163L1Q9NR16 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms