Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9BQ9NQ34 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9BQ9NQ34 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms