Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms