Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOP10Q9NPE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms