Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms